村委会会计应该按照《农村集体经济组织会计制度》的规定，对村民集体经济结余进行处理。具体处理方法如下：
1. 村民集体经济结余的计算：村民集体经济结余是指村民集体经济组织在一定时期内经营活动所形成的盈余，包括收入和支出两部分。一般情况下，村民集体经济结余是由村委会会计进行核算和计算。
2. 村民集体经济结余的处理：根据《农村集体经济组织会计制度》的规定，村民集体经济结余应当按照以下顺序进行处理：
（1）优先用于弥补以前年度的亏损；
（2）其次用于发放集体补贴和奖励；
（3）再次用于公益事业支出；
（4）最后用于村民集体经济组织发展基金。
3. 村民集体经济结余的会计核算：村委会会计应当按照《农村集体经济组织会计制度》的规定，将村民集体经济结余纳入村民集体经济组织的财务报表中，并在年度财务报表中进行披露和说明。同时，应当按照规定向上级主管部门报送相关的财务报表和资料。