当仲裁协议无效后，企业应该采取以下措施：
1.寻求其他解决争议的方式：企业可以寻求其他替代性的争议解决方式，如诉讼、调解等。
2.重新谈判：企业可以重新与对方谈判，寻求达成协议的可能性，以避免争议的进一步扩大。
3.寻求法律援助：企业可以寻求法律援助，以确定如何应对仲裁协议无效所带来的后果。
4.寻求专业意见：企业可以咨询专业人士，如律师、会计师等，以确定应对仲裁协议无效的最佳方案。

总之，企业应该采取积极的措施，以应对仲裁协议无效所带来的后果，避免争议的进一步扩大。