建筑施工企业在处理工程施工中的材料和设备采购成本时，需要遵循以下原则：
1. 根据材料和设备采购合同的约定，确认采购成本。采购成本包括采购价、运输费用、关税、保险费等。
2. 根据实际使用情况，将采购的材料和设备分别计入相应的施工工程成本中。例如，采购的水泥、钢筋、砖瓦等材料计入工程材料成本，采购的挖掘机、起重机等设备计入机械设备成本。
3. 对于已经使用的材料和设备，应当根据实际使用情况计提折旧或摊销，计入施工工程成本中。
4. 对于未使用的材料和设备，应当按照采购成本计入存货中，待下一次施工使用时再计入施工工程成本中。
5. 在处理材料和设备采购成本时，需要注意按照会计准则和税法规定进行会计核算和税务申报。同时，建议建筑施工企业在采购材料和设备时，加强供应商管理，确保采购合同的合法性和真实性，避免因采购成本的不当处理而引发的财务风险。