在建工程的税务处理方式主要是按照《企业所得税法》和《财政部 税务总局关于企业所得税若干问题的规定》的相关规定进行处理。

具体来说，在建工程指的是企业正在进行的工程项目，但尚未完工或尚未投入使用的工程项目。对于在建工程，企业应当按照以下原则进行税务处理：
1. 在建工程不应当计入当期的营业收入和营业成本，而应当计入长期资产。
2. 在建工程的税前成本可以计入企业的财务成本，以减少企业的应纳税所得额。
3. 在建工程的税前成本应当按照实际发生的成本进行计算，包括直接成本和间接成本。
4. 在建工程的税前成本应当按照一定的比例进行分期摊销，分摊期限一般为2-5年。

需要注意的是，在建工程的税务处理方式可能会因为不同的企业类型、不同的工程项目和不同的税务政策而有所不同，具体应当根据实际情况进行处理。