在委托加工物资的会计分录中，应该按照以下方式处理加工过程中的损耗和废品：
1. 损耗的处理：加工过程中的损耗应该按照实际情况进行核算，一般采用“材料损耗费”科目进行核算。具体会计分录为：借：加工费用；贷：原材料（或半成品）材料损耗费。
2. 废品的处理：加工过程中产生的废品应该按照实际情况进行核算，一般采用“废品损失”科目进行核算。具体会计分录为：借：加工费用；贷：废品损失。

需要注意的是，加工费用应该按照实际发生的金额进行核算，并且在会计分录中应该与材料损耗费和废品损失分别进行核算。