矿产资源补偿费是指在矿产资源开采过程中，由开采者向国家支付的一种补偿费用，其计算方法如下：
1. 按照矿产资源所在地区的规定，确定矿产资源补偿费的计算标准和计算方法。
2. 根据矿产资源的类型、储量、品位等因素，计算出矿产资源补偿费的应缴金额。
3. 在矿产资源开采过程中，按照规定的时间和金额向国家支付矿产资源补偿费。

需要注意的是，不同地区和不同矿产资源的补偿费计算标准和计算方法可能存在差异，具体计算方法需要按照当地相关规定进行计算。