长期合同是指合同期间超过一年的合同，权责发生制下的收入和成本是指在合同履行过程中，收入和成本应该按照实际发生的情况进行确认。处理长期合同在权责发生制下的收入和成本，需要按照以下步骤进行：
1. 确定合同的总收入和总成本：在签订合同时，需要确定合同的总收入和总成本，并记录在合同中。
2. 确定每个会计期间的收入和成本：根据合同的履行进度，确定每个会计期间的收入和成本。这可以通过使用百分比完成度法或完工百分比法来计算。
3. 确认收入和成本：按照每个会计期间确定的收入和成本，确认相应的收入和成本。确认收入时，需要考虑收入的可靠性和可确认性。
4. 记录收入和成本：将确认的收入和成本记录在会计账户中，分别归入收入和成本科目中。
5. 计提预提费用：如果确认的成本超过已经支付的成本，需要计提预提费用，将差额记录在预提费用科目中。
6. 计算合同的盈亏：根据确认的收入和成本，计算合同的盈亏情况。如果合同的盈利能力不佳，需要考虑是否需要进行减值处理。

需要注意的是，在处理长期合同的收入和成本时，需要遵守会计准则和税法的规定，并注意合同的风险和变化。