在建工程是指企业正在建设中的工程项目，包括土地平整、基础设施建设、建筑施工、装修装饰等。在建工程的二级科目包括：
1. 建筑工程：包括房屋建筑、桥梁、隧道、道路、水利工程等建筑工程项目。
2. 机电工程：包括电气、通信、给排水、暖通空调等机电工程项目。
3. 安装工程：包括电梯、消防、智能化、环保等安装工程项目。
4. 装修装饰工程：包括室内、外墙、景观、广告等装修装饰工程项目。
5. 其他工程：包括土地平整、园林绿化、临时设施、拆迁补偿等其他工程项目。

以上是在建工程的常见二级科目，具体的科目设置还需要根据企业自身情况进行调整。