与2005年对比，2006年教材并未发生很大变化，其中前三章所得税章节变化较多，主要是针对2005年颁布的几个文件在教材上的补充。
以下是对全书变化之处的具体介绍：
导论
没有变化
第一章 企业所得税
第14页 新增 电信企业营业收入的确定（5）、（6）、（7）
第22页 新增 第6点
第23页 新增 倒数第4-5段
第24页 变化 将（三）中“纳税人的职工工会经费、职工福利费、职工教育经费，分别按计税工资总额的2％、14％和1.5％计算扣除”改为“纳税人的职工工会经费按工资总额的2％计算扣除，除特殊规定外，职工福利费、职工教育经费，分别按计税工资总额的14％和1.5％计算扣除”。
第24页 新增 倒数第5行“电信企业提取的职工教育经费按照计税工资总额2.5％的标准在企业所得税前扣除”。
第25页 新增 第2段
第26页 新增 第7点
第28页 删除 2005年教材第28页坏账确认的6个条件。
第29页 新增 第4点、第5点
第30页 删除 2005年教材第30页（九）资产（财产）损失
第30页 新增 （十）支付给总机构的管理费中第4点
第35－41页 变化 将2005年教材35页“（二十六）企业资产发生永久或实质性损害的损失”更新为“（二十五）企业财产损失在所得税前扣除前扣除的规定”。
第42页 新增 （二十九）、（三十）
第48－49页 新增 倒数第一段以及第49页第一行。
第50页 新增 （二）无形资产的摊销中第9点内容。
第54页 新增 第六点“债转股企业的所得税处理”。
第55页 变化 将2005年教材第48页最后一行、第49页第1行“合并企业和被合并企业为实现合并而向股东回购本公司股份，回购价格与发行价格之间的差额，应作为股票转让所得或损失”改为“合并企业和被合并企业为实现合并而向股东回购本公司股份，回购价格与发行价格之间的差额，属于企业的权益增减变化，不属于资产转让损益，不得从应纳税所得中扣除，也不计入应纳税所得”。
第67页 新增 （三十二）教育机构有关企业所得税规定
第97页 变化 将2005年教材第92页（5）最后两行中“企业应调减的工资费用和工资附加'三费'为：（1200-1000×0.08×12）×（1+2％+14％+1.5％）＝282（万元）”改为“企业应调减的工资费用、职工福利费用和职工教育经费（工会经费可全额扣除）为：”（1200-1000×0.08×12）×（1+14％+1.5％）＝277.2（万元）“
第98页 变化 上述第97页变化导致本页第9点和第10点发生相应变化。
第二章 外商投资企业和外国企业所得税
第107页 新增 第4段
第113页 删除 有关技术开发费享受优惠政策时，需要由主管税务机关审核的有关规定。
第125页 新增 第8点、第9点
第127页 删除 第3点“企业未按规定提出申请……”前删除一段话“前款所称企业，是指投资主体自建、运营上述项目的企业，单纯承揽上述项目建设的施工企业不得享受两年免征，三年减半征收企业所得税的政策。”
第132页 新增 公式下面三段内容
第132页 变化 公式下面的第二个例题，地方所得税税率由“零”改为3％。
第136－137页 变化 征税范围有所删减。
第137页 变化 收入额、应税所得额的确定和应纳税额的计算以及征收方法
第139页 变化 （4）、（5）、（6）
第三章 个人所得税
第142页 变化 表3-1
第144页 删除 个人从事彩票代销业务个人所得税的有关规定
第157页 删除 个人一次取得数月奖金、年终加薪或劳动分红的费用扣除
第159-160页 变化 对个人取得全年一次性奖金计算征收个人所得税的方法
第160页 新增 取得不含税全年一次性奖金收入个人所得税的计算方法
第161页 删除 对实行年薪制的企业经营者应纳个人所得税的计算方法
第161页 变化 对个人因解除劳动合同取得经济补偿金的计税方法
第170页 新增 利息、股息、红利所得的计税方法（一）中第2点、第3点
第172页 新增 第6点“个人因购买和处置债权取得所得征收个人所得税”
第173页 新增 个人所得税的特殊计税方法中例题上面一段
第177－181页 新增 （七）－（十三）
第181页 新增 第12点
第四章 土地增值税
没有变化
第五章 印花税
第220页 新增 纳税人中增加第5点使用人
第224页 新增 第1-2行
第六章 房产税
没有变化
第七章 车船使用税
第231页 删除 对国有运输部门用贷款购买的车船征收车船使用税的有关规定。
第八章 契税
第248－249页 新增 248页最后1行以及249页前4行的有关规定。
第九章 城镇土地使用税
第250页 变化 （三）
第253页 变化 （六）增加“自行”二字。
第254页 变化 （三）
第258页 变化 （二十五）中删除两条规定，新增第6条规定。另新增第（二十八）、（二十九）。
附录
删除《中华人民共和国城市维护建设税暂行条例》
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