这样处理是可以的。在公司安装变电站的过程中，先签订施工合同进行基础建设，并预付工程款，待工程款发票开具后计入在建工程，最后再转入变电站的成本中，这种处理方式符合一般的会计核算原则。 根据《企业会计准则第4号——固定资产》规定，自行建造固定资产的成本，由建造该项资产达到预定可使用状态前所发生的必要支出构成。在安装变电站的过程中，基础建设是变电站达到预定可使用状态前所发生的必要支出，因此可以先计入在建工程。当工程款发票开具后，再将其计入在建工程，以反映实际发生的成本。最后，当变电站达到预定可使用状态时，将在建工程转入固定资产，完成资产的确认和计量。