在这种情况下，公司需要做的是内部调整备用金的记录。首先，应确保员工A同意从其已支取的备用金中划拨5000元给员工B。然后，财务部门需要调整两位员工的备用金记录： 1. 在员工A的备用金记录中，将金额从25000元调整为20000元。 2. 在员工B的备用金记录中，记录新增5000元。 实物操作方面，员工A需要将5000元现金交给财务部门，财务部门再交付给员工B。最后，确保所有操作有相应的书面记录，包括调拨的备忘录或内部转账单，由相关人员签字确认，以保证资金流向的清晰和透明。