抵扣进项税的计算方法为：首先，先算出代订机票费的加权税率，即(6%/17%)＝(6/17)；然后，将代订机票费的金额乘以加权税率即(6/17)；最后，除以1.06得出用于抵扣进项税的金额。例如：机票费总额1000元，抵扣进项税为：1000×(6/17)÷1.06=541.38元。拓展知识，从2020年7月1日起，在全国范围内，航空运输服务费、公共交通运输服务费实行全额税率。