答：在乙加工高档化妆品的案例中，甲方提供上月原料，成本50万元，另外支付不含税运费1万元，取得了小规模运输企业代开的增值税专用发票。乙方收取不含税加工费和辅料费9万元，同时取得乙开具的增值税专用发票。由此可见，此案例中需要支付的增值税为：50万元买入原料的增值税金额和9万元加工费及辅料费的增值税金额。而消费税和城建税则取决于乙日化厂的税收状况，如果乙日化厂是一般纳税人，则应根据实际情况代收代缴消费税和城建税。如果乙日化厂是小规模纳税人，则不需代收代缴消费税和城建税。