这样做是可以的。从财务角度考虑，你公司需要进行成本分摊，将运费支出分摊到每一笔交易中，以便于在计算相关指标时能够反映出每一笔交易的实际成本。但是在分摊运费时，要根据具体情况进行，比如成本的分摊是依据货物的数量、重量或者体积等来进行的，而不是一定要采用借贷的方式。如果你不想进行成本分摊，可以考虑将运费的发票记入公司的财务账户中，并作为公司的预缴费用，记入预付款项即可。