对于已经勾选过的增值税专用发票抵扣联，应首先检查有无异常。如果没有异常，应当将其存放于记账凭证和抵扣联的相关存档柜中，以备后续核查使用。若发现有异常，应按发票稽核流程操作，确认是否存在虚开、发票退票、发票有误调出等情况；同时，应根据《增值税发票管理办法》的规定，将发票的原始资料妥善保存，以备核查使用。 拓展知识： 增值税专用发票抵扣联是根据《增值税发票管理办法》规定，由纳税人当期开具的专用发票的三联单据的第三联，并由发票领购方签收后保存，用于计算当期应纳税额。发票领购方在申报纳税时，需要提供增值税专用发票抵扣联，以证明发票购买费用是真实有效的且可以用于抵扣税款的费用。