是的，小规模企业可以开农产品收购发票。根据《发票管理办法》，小规模企业可以开立增值税专用发票。因此，小规模企业也可以开立农产品收购发票，其发票格式与增值税专用发票相同，含有税控码，发票代码，发票号码，开票日期以及发票类型等内容，并主要由购货方开具，采购方收取。 该发票规定，销售方在购销协议中提供的农产品收购发票，须以购销协议内容为依据，由有发票开具权的购买方根据生产经营单位的销售内容开具发票，并由有发票收取权的销售方索取发票。 拓展知识：农产品收购发票，除了用于核定收购的相关金额外，也可以用于税收管理规定的纳税等其他目的，因此，建议企业在开具农产品收购发票时，应按照流程要求，如实填写购买内容，以便获得更好的税收管理效果。