处理增值税发票联丢失可以按照《增值税暂行条例》及相关税务机关的规定办理。 一般来说，当发票联被遗失的，可以持有发票的购货方向增值税纳税申报表的开票方申请补开发票联。补开发票联的，应由增值税税务机关登记备案，及时修改增值税纳税申报表，套打发票时带有原发票联的信息完整。 此外，如果发票联被遗失，则购货方还可以拿出原发票、购货合同及其它有关凭证，向增值税税务机关申请补开发票联，并且相关税务机关出具补开发票联的相关证明文件。 其拓展知识： 发票联的遗失也会带来一定的法律后果，如发票联被遗失、发票联与实际发票信息不符等情况，可能导致购货方因没有发票联而遭受税务机关误罚等情况发生。因此，购货方和开票方应及时补开发票联，把发票联和发票绑定，以避免不必要的纳税纠纷。