已经付款却没有发票，可以采取以下几种方式进行审计： 1. 通过账户流水记录查询和核对：可以登录账户查询该笔交易具体的付款信息，如付款方的名称，付款时间，付款金额等，然后与付款方的凭证或其他证据核对，以验证是否交易存在。 2. 通过借贷双方的签字确认：可以要求借款双方签字确认已付款，以确认付款是否存在。 3. 通过专业机构审计：可以委托专业的审计机构进行审计，以验证交易是否存在。 此外，还应该强调的是，当发生此类交易时，企业应当结合实际情况，根据财务规范要求，采取措施，加强采购管理，审查采购合同，验证采购发票，强化记账等内部控制活动，以便更好地管理财务风险，避免发生重大财务事故。 拓展知识：审计的核心内容主要有的内容有：验证会计记录和报表的真实性、准确性、合法性和完整性，即审计范围包括会计数据的实时更新以及财务报表的准确性等。