应该将发生的运费计入应付职工薪酬科目和其他应付款科目。首先，要将发生的运费分开计入应付职工薪酬科目和其他应付款科目，应该确定报销的是运费还是职工的出差费用，如果是出差费用应该计入应付职工薪酬，如果是运费应该计入其他应付款；其次，如果报销出差费用属于公司在b公司外地出差，并且是预计支出，未达到实际支出，应该将出差费用计入应付职工薪酬。同时，如果出差费用已经实际支出，那么该笔支出应该计入其他应付款中。 拓展知识：总的来说，报销发生的运费，应付职工薪酬及其他应付款这两个科目费用的分配分别要严格按照公司的报销规定进行，在报销完成后，应当清楚的打印报销单，对实际发生的费用清楚明确，以免发生纠纷。