公司可以根据公司法和会计准则的规定，采取以下方式处理盈余公积的余额：
1. 用于弥补公司亏损：如果公司出现亏损，可以将盈余公积中的余额用于弥补亏损，但必须先用其他各项公积金和利润补充亏损后才能使用。
2. 转增股东：公司可以将盈余公积中的余额转为股本，向股东转增股份，但必须经过股东大会决议，并按照公司法和证监会的规定进行。
3. 投资扩大经营：公司可以将盈余公积中的余额用于投资扩大经营，但必须符合公司的经营计划和投资决策，并且必须经过董事会和股东大会的决议。
4. 其他用途：公司还可以将盈余公积中的余额用于其他用途，如支付股息、偿还债务等，但必须符合公司法和会计准则的规定。

需要注意的是，任何时候使用盈余公积的余额都必须经过董事会和股东大会的决议，并且必须按照公司法和会计准则的规定进行。