A单位属非房地产企业，2006年取得的非住宅房屋，有购房发票，非自建，且有契税发票原件，契税发票计税金额与集资建房合同金额相等。2019年转让，委托中介出具房屋重置评估报告，请问老师：

（1）2019年转让时，增值税应按差额计税，土地增值税按重置评估价格扣除计算，还是按发票原值加计 扣除计算？

（2）如果两种计算方式其中之一对纳税人更有利，纳税人有权选择采取有利于自己的计税方式吗？

（3）如果纳税人或税务机关对土地增值税选择按评估价格计算时，增值税还可以按差额计税吗？

  因为实务中，税务机关有工作人员答复，当土地增值税采取按评估价格扣税计税时，增值税只能采取全额计税方式，理由是当土地增值税采取按评估价格扣除时，即征税人不知道房产取得原始价格，而增值税如果采取差额计税，就肯定知道房产取得原始价格，两项合计自相矛盾，所以税务机关某工作人员，对纳税人要求是，要么土地增值税按发票加计扣除、同时增值税按差额计算；要么土地增值税按评估价格扣除、同时增值税按全额计算。本人不同意税务机关工作人员答复，想问老师。

  非常谢谢！！！