注册会计师应当确定财务报表是否需要修改（选项B）；与管理层和治理层讨论该事项；如果需要修改，询问管理层将如何处理。如果管理层修改了财务报表，注册会计师应当针对修改后的财务报表出具新的审计报告（选项A）；注册会计师应当在新的或经修改后审计报告中增加强调事项段或其他事项段（选项C）；如果管理层未采取任何行动，注册会计师应当采取措施防止财务报表使用者信赖该审计报告（选项D）。