注册会计师在审计工作中遇到的重大困难可能包括下列事项：（1）在提供审计所需信息时管理层严重拖延或不愿意提供，或者被审计单位的人员不予配合（选项B）；（2）不合理地要求缩短完成审计工作的时间；（3）为获取充分、适当的审计证据需要付出的努力远远超过预期；（4）无法获取预期的信息；（5）管理层对注册会计师施加的限制（选项C）；（6）管理层不愿意按照要求对被审计单位持续经营能力进行评估（选项D），或不愿意延长评估期间（选项A）。