在企业支付员工医药费时，一般采取以下操作： 1）员工提供医药费的支付单据，附上全职员工的身份证，费用清单以及医疗发票； 2）经企业审核合法性，确认全额支付，企业通过基本户将该笔费用打到该员工银行卡上； 3）经企业财务审核，确认该款项已打到员工账户，将确认支付信息记录在企业支付记录中； 4）若企业支付上述费用后，员工因个人原因在上班时受伤，且金额较小，没有报工伤，则需要企业提前跟员工确认无需企业支付工伤保险费用，并将确认信息记录在企业支付记录中。 拓展知识： 为加强企业支付员工医药费的管理，企业可以制定医药费支付专项账户，用于支付员工医药费，确保支付的合法性和有效性。另外，企业也应在支付前对医药费用进行核实，确保不存在超标、报销不当等行为。